Os cursos de doutorado e mestrado possuem como objetivo a formação de pesquisadores juniores e seniores na área de Ciências Contábeis, estimulando o desenvolvimento de pesquisas em organizações públicas e privadas a partir dos conhecimentos adquiridos na área de Ciências Contábeis.

O Programa de Pós-graduação em Ciências Contábeis da Universidade de Brasília não é apenas uma continuação do Programa anterior (o Programa Multi-institucional e Inter-regional de Pós-graduação em Ciências Contábeis da UnB/UFPB/UFRN) e, sim, um novo programa de pós-graduação. Entretanto, é verdade que um corpo docente com orientações já concluídas em nível de mestrado e  doutorado proporciona à UnB uma experiência ímpar e visão madura de formação que irão se somar ao processo de consolidação dos novos cursos.

Nesse sentido, no que diz respeito à área de concentração, as linhas e os grupos de pesquisa não são significativamente diferentes dos existentes no modelo anterior. O programa divide-se em duas linhas de pesquisa: “Contabilidade e Mercado Financeiro” e “Impactos da Contabilidade no Setor Público, nas Organizações e na Sociedade”. Cada linha de pesquisa abriga projetos e grupos de pesquisa desenvolvidos por professores e alunos do quadro do programa.